Il clima cambia molto tra coste, altopiani e regioni del Sud. In generale, la stagione più favorevole per un itinerario completo va da aprile a ottobre, quando il clima è più fresco e asciutto.
Il Nord e Nosy Be sono particolarmente piacevoli tra maggio e ottobre; il Sud-Ovest, più secco, può essere visitato per gran parte dell’anno. Periodo e percorso vanno comunque valutati insieme in base alle zone scelte.